重复序列越多复杂度越高
2022-12-21阅读(170)
问：为什么重复序列越多的DNA复性越快
- 答：原理是这昂的：
重复序列多，说明这一段DNA序列是由很多相同的序列加以重复而组成的。复性过程是两条互补的双链结合的过程，如果重复序列多的话，那么互补的两个序列更容易遇见而复性。
举个例子，比如ATATATAT这个序列，和ATCGATCG这个序列相比，"AT"这个重复更容易遇见“AT”这个重复来复性，而“ATCG”这个重复则不容易遇见ATCG这个重复，因此前者互补的概率是后者的2倍，也就是说，前者容易复性。
明白？
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我是三楼。
你的这句话“比如说甲链中一个“AT”只能与乙链中相应的两个“TA”形成氢键，而不能与其它的“TA”形成氢键。”是错误的。因为碱基的互补并不依赖于位置，只要遇到能够互补的碱基，就能形成氢键。例如在我的例子中，第一个AT是可以和第二个或者第三个AT互补产生氢键的。
注意，在宏观上，DNA退火只是从单链重新回到双链的过程，并不要求和变形之前的DNA要完全一致。事实上，在多拷贝重复序列的退火过程中，是很容易发现滑动错配的现象的。 - 答：DNA复性 与DNA顺序的复杂性有关
简单顺序的DNA分子,如多聚(A)和多聚(U)这二种单链序列复性时,互补碱基的配对较易实现。而顺序复杂的DNA,如DNA的非重复部分,一般以单拷贝存在于基因组中,这种复杂特定序列要实现互补,显然要比上述简单序列困难得多。
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纯粹探讨下
那为什么““ATCG”这个重复不容易遇见ATCG这个重复”？复性产生在两条链之间ATCG 遇见 ATCG干嘛？
我觉得这只是种特性，就好像惯性定律，任何物体在不受任何外力的作用下，为什么总保持匀速直线运动状态或静止状态，直到有外力迫使它改变这种状态为止？你说要怎么解释？ - 答：因为要表达同一个蛋白质特性，重复的越多，真正用于表达的就越分散，就越复杂吧~~
- 答：你还不如问公路好走还是山路好走
问：DNA复性的DNA顺序的复杂性
- 答：简单顺序的DNA分子，如多聚（A）和多聚（U）这二种单链序列复性时，互补碱基的配对较易实现。而顺序复杂的DNA，如小牛DNA的非重复部分，一般以单拷贝存在于基因组中，这种复杂特定序列要实现互补，显然要比上述简单序列困难得多。在核酸复性研究中，定义了一个Cot的术语，（Co为单链DNA的起始浓度，t是以秒为单位的时间），用以表示复性速度与DNA 顺序复杂性的关系。在探讨DNA顺序对复性速度的影响时，将温度、溶剂离子强度、核酸片段大小等其它影响因素均予以固定，以不同程度的核酸分子重缔合部分（在时间t时的复性率）取对数后对Cot作图，可以得到如图所示的曲线，用非重复碱基对数表示核酸分子的复杂性。如多聚（A）的复杂性为1，重复的（ATGC)n组成的多聚体的复杂性为4，分子长度是105核苷对的非重复DNA的复杂性为105。原核生物基因组均为非重复顺序，故以非重复核苷酸对表示的复杂性直接与基因组大小成正比,对于真核生物基因组中的非重复片段也是如此。在标准条件下（一般为0.18ml/L阳离子浓度，400核苷酸的长的片段）测得的复性率达0.5时的Cot值（称Cotl/2），与核苷酸对的复杂性成正比。对于原核生物核酸分子，此值可代表基因组的大小及基因组中核苷酸对的复杂程度。真核基因组中因含有许多不同程度的重复序列（repetitive sequence），所得到的Cot曲线要S曲线复杂。
问：一段重复的序列为什么会让终止子提前
- 答：一段重复的序列会让终止子提前是因为重复次数越多破解就越快。大部分中度重复序列与基因表达的调控有关。
